警队的“绝密档案”，是指至今仍未侦破，科学查证又不能合理解释的悬疑案件。阳任职警察部专案小组十多年，对这些谜题甚感兴趣，奈何职权所限，遂决定与好友Judy请辞警队并成立天眼研究所。成立第一天，一位神秘人物出现，提供经费并留下Helen的失踪档案。经调查后，二人发现Helen与失落文明玛雅文化有关，考古学家推论这文明乃外星人所建立，更与末日预言扯上关系
伟、铭和珍三人自幼青梅竹马，伟、铭两人同时爱着珍，唯伟因富有而得珍欢心，铭决定往南洋拜降头师拉宝。铭学成回港寻伟、珍，并相约露登，铭施苦肉计，将自己抓伤，二人送铭入院，群医束手无策，铭说只有南洋降头师拉宝可救他。伟与珍赴南洋找得拉，他骗珍之头发和血液制成"爱情降"，珍突然出走，伟不知所措，幸得另一降头师苏菲亚帮助，拯救珍，珍在林中独行，雾中遇上铭，自动献身，二人林中缱绻难分，苏与伟赶到，并施法为珍解降……
明朝嘉靖年间，抗倭名将张经为奸臣所害，倭寇在汉人王直和日本人小泉的率领下，乘机大肆入侵东南沿海，烧杀抢掠，无恶不作。明朝官兵一再溃败。戚继光受命到浙江义乌招募壮士，成立戚家军，以对抗倭寇。 冯子明将军为义乌籍人氏，与戚继光同行，他也是戚继光此行募兵的向导。为安全，两人扮成普通生意人，向义乌而来。两人途经一个刚刚被倭寇洗劫过的村庄，村民均遭屠杀，唯一的活口是村口树上被钉着的一个男子。这是倭寇惯用的伎俩，让人求生不得，求死不能。男子告诉戚继光，是王直亲自率领倭寇来屠村的。男子不愿等死，哀求戚继光杀了他，给他个痛快。戚继光虽然不忍，但最终还是杀了那男子。 戚继光和冯子明为被害村民进行了火葬。看见熊熊火焰将尸体吞没，烟雾弥漫半空，戚继光再也控制不住心头的愤怒，不顾冯子明的劝阻，只身匹马追击王直而去。 追至一处，戚继光勒住马，查看路上的马蹄印，他判断出王直就在...
讲述了矿区工人老林被律师告知前妻钟萍过世时给在大城市做艺术的儿子林冲留下了一套房产，但需要签订一份“黑色协议”——儿子必须在老林自然死亡或者意外身故之后才可获得这份房产。城市的房价太高，老林只靠自己的能力很难帮儿子在大城市立足，于是他尝试伪造各种意外现场，但都以失败告终。最终老林烧毁了协议，却在车站抓小偷时被刺伤意外身亡。
对于新闻记者来说，每一次赶往新闻现场都是一次同行间的赛车比赛。《香港日报》的老记者阿苦（周华健 饰）浸淫行业多年，这天却因为采编不力被主编痛批。同日，从美国留学归来的新丁记者Peter王（吴彦祖 饰）到报馆报到，主编顺势将Peter塞给阿苦照顾。报社之花Joey（张可颐 饰）决定采访为女同学出头反遭退学处理的学生社团分子阿伟，隐瞒身份接近后者。另一方面，阿苦为了采访珠宝展拜访担任展览安保的老朋友麦警官，希望得到独家消息，Peter则得到了一个新手任务：采访因为交通事故陷入窘境的孤儿姐弟三人。三人为了各自的新闻努力与当事人沟通调查，引发了三段充满真情的故事……
社团大哥大华（任达华 饰）通过鸡包（林雪 饰）的安排前去执行非常棘手的社团任务，于是重新召集自己手下最信得过的兄弟阿春（陈小春 饰）、高天（伍允龙 饰）、叉烧（张兆辉 饰）、超人（梁烈唯）以及自己的女儿（邱意浓 饰）一同重出江湖，不料在执行任务时，却一次次失败，遭遇社团和警方的双重围剿，兄弟几人不得不拨开重重迷雾，抓出内鬼，找出真相……
亚洲某市的特勤陈子默无意中发现自己身陷囹圄，经过调查他发现这一切的危机都来源于自己脑内的一块芯片为了不让芯片落入坏人手中，陈子默决定只身与恶势力对抗。最后陈子默用自己的牺牲让芯片从这个世界上消失。
剧集由三个故事组成。 《富豪村》：在编辑泉京香（饭丰万理江 饰）的怂恿之下，岸边露伴（高桥一生 饰）和她一同前往一处名叫“富豪村”的别墅区拜访。这里的豪宅以极低的价格正在出售之中，然而，想要见到卖主，必须要通过他的礼仪考验。 《KUSHAGARA》：岸边露伴在街边偶遇了名为志士十五（森山未来 饰）的同行漫画家，十五告诉岸边路边，他的责编禁止他在漫画里使用“KUSHAGARA”这个词，然而却没有告诉他这个词到底是什么意思。非常想知道其中含义的十五因为执念渐渐陷入了癫狂之中。 《D.N.A》：泉京香的男友太郎（中村伦也 饰）在6年前因为一场车祸而失去了记忆，一直到今天都没有从车祸的阴影里完全走出。一天，他们在路上偶然遇见了推着婴儿车的女子片平真依（泷内公美 饰），就在她经过太郎身旁时，婴儿车里伸出了一只手抓住了太郎。
本季开篇就让观众忍不住猜想：看起来只是阿什公馆的普通清晨，结果却出人意料。这一季中，有哪些秘密会被揭开，又有哪些秘密将永远封存？ 巴特：为了使詹姆斯的性向不为人所知，乔治给了巴特一笔封口费。贪婪的巴特想继续勒索，却在几天后被人发现死在河边。 莎拉：第一季中，有着神秘身世的故事莎拉·亚当斯在游轮上救下了欲自杀的詹姆斯·布莱。被迫保守这个秘密使莎拉和布莱一家有了交集：与乔治的接触让莎拉慢慢走出遭纳粹迫害致死的丈夫的阴影，而她跟乔治也渐渐暗生情愫。本季，莎拉将搬到阿什公馆来证明自己能做好乔治的妻子；与此同时布莱老夫人却指派蕾吉娜去调查莎拉在欧洲不为人所知的过往。 杰克：杰克跟卡洛琳大发雷霆，因为他才知道他们生了一个女儿，杰克铁了心想找到女儿。 卡洛琳：刚刚母女相认的卡洛琳想维持现状，暂时不想让女儿的父亲扰乱女儿的心。 安娜：安娜暂住普莱提家，学做农夫的妻子...